Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITX1P78337 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITX1P78337 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PITX1P78337 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PITX1P78337 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITX1P78337 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITX1P78337 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PITX1P78337 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX1P78337 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX1P78337 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX1P78337 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX1P78337 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITX1P78337 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX1P78337 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX1P78337 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX1P78337 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX1P78337 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITX1P78337 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITX1P78337 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms