Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ACTG1P63261 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTG1P63261 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTG1P63261 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms