Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPNP63162 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPNP63162 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPNP63162 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms