Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERVK_113P63121 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63121 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms