Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2LP62875 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2LP62875 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms