Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPL23AP62750 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23AP62750 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms