Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPFP62306 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPFP62306 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPFP62306 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPFP62306 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms