Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMO4P61968 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LMO4P61968 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LMO4P61968 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LMO4P61968 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LMO4P61968 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMO4P61968 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LMO4P61968 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LMO4P61968 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LMO4P61968 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LMO4P61968 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LMO4P61968 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LMO4P61968 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LMO4P61968 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms