Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF3P61204 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF3P61204 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF3P61204 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF3P61204 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF3P61204 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF3P61204 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF3P61204 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF3P61204 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF3P61204 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF3P61204 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF3P61204 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF3P61204 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF3P61204 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF3P61204 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARF3P61204 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARF3P61204 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARF3P61204 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARF3P61204 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARF3P61204 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF3P61204 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF3P61204 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF3P61204 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF3P61204 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARF3P61204 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARF3P61204 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms