Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS2P61201 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS2P61201 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS2P61201 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS2P61201 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS2P61201 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS2P61201 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS2P61201 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS2P61201 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS2P61201 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS2P61201 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS2P61201 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS2P61201 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS2P61201 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPS2P61201 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPS2P61201 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms