Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTR3P61158 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR3P61158 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms