Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC13P55735 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC13P55735 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC13P55735 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEC13P55735 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEC13P55735 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC13P55735 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC13P55735 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC13P55735 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEC13P55735 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC13P55735 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC13P55735 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC13P55735 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC13P55735 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC13P55735 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC13P55735 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC13P55735 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC13P55735 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC13P55735 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC13P55735 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC13P55735 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC13P55735 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC13P55735 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC13P55735 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC13P55735 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC13P55735 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC13P55735 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC13P55735 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC13P55735 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms