Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDH15P55291 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDH15P55291 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH15P55291 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH15P55291 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH15P55291 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH15P55291 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH15P55291 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH15P55291 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH15P55291 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH15P55291 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH15P55291 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH15P55291 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH15P55291 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH15P55291 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH15P55291 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH15P55291 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH15P55291 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH15P55291 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH15P55291 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH15P55291 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH15P55291 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH15P55291 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH15P55291 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms