Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH8P55286 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH8P55286 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDH8P55286 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDH8P55286 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH8P55286 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH8P55286 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH8P55286 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH8P55286 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH8P55286 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH8P55286 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH8P55286 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH8P55286 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH8P55286 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH8P55286 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH8P55286 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH8P55286 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH8P55286 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH8P55286 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH8P55286 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH8P55286 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH8P55286 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH8P55286 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH8P55286 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH8P55286 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH8P55286 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH8P55286 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH8P55286 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH8P55286 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms