Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLTPP55058 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLTPP55058 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLTPP55058 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLTPP55058 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLTPP55058 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLTPP55058 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLTPP55058 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PLTPP55058 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLTPP55058 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLTPP55058 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLTPP55058 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLTPP55058 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLTPP55058 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLTPP55058 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms