Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP12AP54707 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP12AP54707 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms