Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB3P54284 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB3P54284 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB3P54284 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB3P54284 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms