Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HIRAP54198 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRAP54198 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRAP54198 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRAP54198 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRAP54198 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HIRAP54198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HIRAP54198 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRAP54198 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRAP54198 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRAP54198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRAP54198 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRAP54198 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRAP54198 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRAP54198 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRAP54198 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRAP54198 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRAP54198 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HIRAP54198 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRAP54198 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRAP54198 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRAP54198 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRAP54198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIRAP54198 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRAP54198 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRAP54198 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRAP54198 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRAP54198 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIRAP54198 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRAP54198 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRAP54198 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRAP54198 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIRAP54198 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HIRAP54198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HIRAP54198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIRAP54198 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIRAP54198 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIRAP54198 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HIRAP54198 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIRAP54198 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIRAP54198 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIRAP54198 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRAP54198 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRAP54198 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIRAP54198 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms