Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 SOG2YOR353C 2376 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ISR1YPR106W 1332 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YMR114CYMR114C 1107 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 PRI2YKL045W 1587 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 GUA1YMR217W 1578 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 CYK3YDL117W 2658 nt5.8□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 URA7YBL039C 1740 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 APE1YKL103C 1545 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 TNA1YGR260W 1605 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YCR006CYCR006C 474 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YDL057WYDL057W 987 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YKR075CYKR075C 924 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 STM1YLR150W 822 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 SEC13YLR208W 894 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YLR317WYLR317W 435 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MEC3YLR288C 1425 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 MBP1YDL056W 2502 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 STE20YHL007C 2820 nt5.79□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 SEC39YLR440C 2130 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 AMD1YML035C 2433 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ADE12YNL220W 1302 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 GLE1YDL207W 1617 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 YGL185CYGL185C 1140 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 PEX12YMR026C 1200 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 PHA2YNL316C 1005 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ATE1YGL017W 1512 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 DPB2YPR175W 2070 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 DBP9YLR276C 1785 nt5.78□□□□□ -1.48
YNL058CP53947 ATG1YGL180W 2694 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 WTM2YOR229W 1404 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SNZ3YFL059W 897 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SIP2YGL208W 1248 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SNZ2YNL333W 897 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 UBC11YOR339C 471 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YDR109CYDR109C 2148 nt5.77□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GPI18YBR004C 1302 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 MCX1YBR227C 1563 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 FYV1YDR024W 486 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 CWC21YDR482C 408 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GAL83YER027C 1254 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SFC1YJR095W 969 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GFD1YMR255W 567 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 MTQ1YNL063W 945 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 RET1YOR207C 3450 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GIP1YBR045C 1920 nt5.76□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SMF2YHR050W 1650 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SVF1YDR346C 1446 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SEC20YDR498C 1152 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 EAF5YEL018W 840 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YGR291CYGR291C 222 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 ENV7YPL236C 1095 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.75□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YDL114WYDL114W 927 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 APS3YJL024C 585 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 MOG1YJR074W 657 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 IMD1YAR073W 1212 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YEF1YEL041W 1488 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 WHI4YDL224C 1950 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GSY2YLR258W 2118 nt5.74□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 HPC2YBR215W 1878 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 MAD2YJL030W 591 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SPC24YMR117C 642 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YNL234WYNL234W 1281 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 CSG2YBR036C 1233 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 YBR144CYBR144C 315 nt5.73□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 PRT1YOR361C 2292 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 GRX4YER174C 735 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SUA5YGL169W 1281 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 SAP155YFR040W 3009 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 UGA1YGR019W 1416 nt5.72□□□□□ -1.49
YNL058CP53947 ARN1YHL040C 1884 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 CLA4YNL298W 2529 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YJR085CYJR085C 318 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 DBR1YKL149C 1218 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 CSR1YLR380W 1227 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YNL019CYNL019C 855 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YNL033WYNL033W 855 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 POR1YNL055C 852 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RPS15YOL040C 429 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 AAD15YOL165C 432 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 MCM4YPR019W 2802 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 ENT2YLR206W 1842 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 SEC9YGR009C 1956 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YML082WYML082W 1950 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 VHS2YIL135C 1311 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 EXO1YOR033C 2109 nt5.71□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 GCR2YNL199C 1605 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YEA6YEL006W 1008 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 PRE3YJL001W 648 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 CAM1YPL048W 1248 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 MUM3YOR298W 1440 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 UBA2YDR390C 1911 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 YAP1801YHR161C 1914 nt5.7□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 TBF1YPL128C 1689 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 RGT1YKL038W 3513 nt5.69□□□□□ -1.5
YNL058CP53947 MDH3YDL078C 1032 nt5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.7 ms