Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ATH1	YPR026W	3636 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	PRI2	YKL045W	1587 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	SEC20	YDR498C	1152 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	PGA2	YNL149C	390 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	UBC11	YOR339C	471 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ECM2	YBR065C	1095 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.48	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	UTP18	YJL069C	1785 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	RIM15	YFL033C	5313 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	YHL018W	YHL018W	363 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	DRE2	YKR071C	1047 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	QRI5	YLR204W	336 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	GLT1	YDL171C	6438 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.47	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	PHO90	YJL198W	2646 nt		5.46	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	ARB1	YER036C	1833 nt		5.46	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	BPL1	YDL141W	2073 nt		5.46	□□□□□ -1.53
DSL1	P53847	OPI7	YDR360W	435 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	MDH1	YKL085W	1005 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SRY1	YKL218C	981 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	MTQ1	YNL063W	945 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	REG2	YBR050C	1017 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	MRPS5	YBR251W	924 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.46	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	GCV3	YAL044C	513 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	HCR1	YLR192C	798 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	MBP1	YDL056W	2502 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YTA6	YPL074W	2265 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	HES1	YOR237W	1305 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	GLE1	YDL207W	1617 nt		5.45	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SIR2	YDL042C	1689 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	ATO3	YDR384C	828 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SCS2	YER120W	735 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	PRP43	YGL120C	2304 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YLR346C	YLR346C	306 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	TAF11	YML015C	1041 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SPG4	YMR107W	348 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YNL194C	YNL194C	906 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YBR144C	YBR144C	315 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	GPR1	YDL035C	2886 nt		5.44	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	PDH1	YPR002W	1551 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SNF11	YDR073W	510 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	APS3	YJL024C	585 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	JJJ3	YJR097W	519 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YJU2	YKL095W	837 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	RNH201	YNL072W	924 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	RPS15	YOL040C	429 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YPL136W	YPL136W	369 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YMD8	YML038C	1329 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	AMD1	YML035C	2433 nt		5.43	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	MSC7	YHR039C	1935 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YNL247W	YNL247W	2304 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	RML2	YEL050C	1182 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YFR035C	YFR035C	345 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	DOT5	YIL010W	648 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YDR261C-D	YDR261C-D	4815 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SKS1	YPL026C	1509 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	ADE12	YNL220W	1302 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	RPT4	YOR259C	1314 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	VPS72	YDR485C	2388 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	PRP40	YKL012W	1752 nt		5.42	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	NOP7	YGR103W	1818 nt		5.41	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SSY5	YJL156C	2100 nt		5.41	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	GRE1	YPL223C	507 nt		5.41	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	SNT2	YGL131C	4212 nt		5.41	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	YOR1	YGR281W	4434 nt		5.41	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	STL1	YDR536W	1710 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	ATG18	YFR021W	1503 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	EAF5	YEL018W	840 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	CSG2	YBR036C	1233 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	RPS9A	YPL081W	594 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	HAL1	YPR005C	885 nt		5.4	□□□□□ -1.54
DSL1	P53847	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.4	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	HOS2	YGL194C	1359 nt		5.4	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	SEC12	YNR026C	1416 nt		5.4	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	GLO2	YDR272W	825 nt		5.39	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	UBP9	YER098W	2265 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YDL114W	YDL114W	927 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	CDC43	YGL155W	1131 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	NQM1	YGR043C	1002 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YML018C	YML018C	1182 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YNR048W	YNR048W	1182 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	AIM17	YHL021C	1398 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	COR1	YBL045C	1374 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.38	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	DAL81	YIR023W	2913 nt		5.37	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	SYG1	YIL047C	2709 nt		5.37	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	FAA3	YIL009W	2085 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	BUL1	YMR275C	2931 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		5.36	□□□□□ -1.55
DSL1	P53847	ADK2	YER170W	678 nt		5.36	□□□□□ -1.55

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