Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACLYP53396 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACLYP53396 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACLYP53396 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACLYP53396 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACLYP53396 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACLYP53396 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ACLYP53396 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACLYP53396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACLYP53396 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACLYP53396 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACLYP53396 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACLYP53396 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ACLYP53396 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACLYP53396 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACLYP53396 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACLYP53396 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms