Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EFNA3P52797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA3P52797 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms