Protein–RNA interactions for Protein: P50749

RASSF2, Ras association domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF2P50749 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RASSF2P50749 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RASSF2P50749 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms