Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERFP50548 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERFP50548 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERFP50548 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERFP50548 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERFP50548 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERFP50548 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERFP50548 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERFP50548 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERFP50548 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERFP50548 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERFP50548 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERFP50548 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERFP50548 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERFP50548 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERFP50548 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERFP50548 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERFP50548 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERFP50548 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERFP50548 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERFP50548 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERFP50548 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERFP50548 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERFP50548 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERFP50548 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERFP50548 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERFP50548 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERFP50548 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERFP50548 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERFP50548 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERFP50548 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERFP50548 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms