Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK8P49336 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK8P49336 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK8P49336 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDK8P49336 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDK8P49336 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDK8P49336 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDK8P49336 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDK8P49336 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDK8P49336 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDK8P49336 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDK8P49336 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDK8P49336 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDK8P49336 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK8P49336 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CDK8P49336 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDK8P49336 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDK8P49336 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK8P49336 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK8P49336 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK8P49336 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDK8P49336 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDK8P49336 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK8P49336 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDK8P49336 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK8P49336 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK8P49336 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK8P49336 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDK8P49336 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK8P49336 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK8P49336 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDK8P49336 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDK8P49336 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK8P49336 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK8P49336 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK8P49336 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDK8P49336 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK8P49336 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDK8P49336 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK8P49336 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK8P49336 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK8P49336 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK8P49336 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDK8P49336 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK8P49336 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDK8P49336 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK8P49336 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK8P49336 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDK8P49336 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDK8P49336 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms