Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCKSL1P49006 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MARCKSL1P49006 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms