Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NRIP1P48552 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NRIP1P48552 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NRIP1P48552 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NRIP1P48552 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms