Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RGRP47804 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RGRP47804 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RGRP47804 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RGRP47804 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGRP47804 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGRP47804 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGRP47804 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGRP47804 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RGRP47804 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RGRP47804 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGRP47804 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGRP47804 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGRP47804 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGRP47804 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGRP47804 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGRP47804 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGRP47804 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGRP47804 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGRP47804 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGRP47804 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGRP47804 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGRP47804 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGRP47804 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGRP47804 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RGRP47804 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGRP47804 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGRP47804 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RGRP47804 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RGRP47804 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGRP47804 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGRP47804 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGRP47804 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RGRP47804 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RGRP47804 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms