Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSR1P43307 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSR1P43307 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSR1P43307 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSR1P43307 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SSR1P43307 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSR1P43307 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSR1P43307 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSR1P43307 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSR1P43307 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms