Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTTP42858 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTTP42858 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTTP42858 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTTP42858 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTTP42858 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTTP42858 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HTTP42858 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HTTP42858 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTTP42858 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTTP42858 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTTP42858 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTTP42858 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTTP42858 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTTP42858 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTTP42858 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTTP42858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTTP42858 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTTP42858 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTTP42858 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HTTP42858 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTTP42858 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTTP42858 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTTP42858 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTTP42858 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HTTP42858 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTTP42858 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTTP42858 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTTP42858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HTTP42858 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HTTP42858 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTTP42858 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTTP42858 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTTP42858 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HTTP42858 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HTTP42858 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTTP42858 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTTP42858 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HTTP42858 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms