Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGDSP41222 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGDSP41222 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGDSP41222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDSP41222 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDSP41222 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGDSP41222 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGDSP41222 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGDSP41222 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGDSP41222 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGDSP41222 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDSP41222 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms