Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP8P40818 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP8P40818 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP8P40818 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP8P40818 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP8P40818 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP8P40818 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP8P40818 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP8P40818 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP8P40818 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP8P40818 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP8P40818 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP8P40818 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP8P40818 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP8P40818 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP8P40818 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP8P40818 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP8P40818 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP8P40818 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP8P40818 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
USP8P40818 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP8P40818 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP8P40818 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP8P40818 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP8P40818 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP8P40818 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms