Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPGP40121 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPGP40121 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPGP40121 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPGP40121 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPGP40121 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPGP40121 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPGP40121 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPGP40121 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPGP40121 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPGP40121 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPGP40121 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPGP40121 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPGP40121 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms