Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIK1P39086 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIK1P39086 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIK1P39086 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms