Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SREBF1P36956 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF1P36956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SREBF1P36956 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms