Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5C1P36542 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP5C1P36542 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP5C1P36542 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms