Protein–RNA interactions for Protein: P35736

YKL050C, Uncharacterized protein YKL050C, yeast

Predictions only

Length 922 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	P35736	RPS15	YOL040C	429 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SUE1	YPR151C	621 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	RSC30	YHR056C	2652 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.92	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SFB3	YHR098C	2790 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	URA3	YEL021W	804 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SIP2	YGL208W	1248 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SFC1	YJR095W	969 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SEC13	YLR208W	894 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.91	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	RNR3	YIL066C	2610 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	GIP1	YBR045C	1920 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	SYF2	YGR129W	648 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	HCR1	YLR192C	798 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	TAF11	YML015C	1041 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	LST8	YNL006W	912 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	CKA2	YOR061W	1020 nt		5.9	□□□□□ -1.46
YKL050C	P35736	PIF1	YML061C	2580 nt		5.9	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	TRK2	YKR050W	2670 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	RRT2	YBR246W	1164 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	APM1	YPL259C	1428 nt		5.89	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	BAP2	YBR068C	1830 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	HST4	YDR191W	1113 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	RFA2	YNL312W	822 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YJR124C	YJR124C	1347 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	DFG5	YMR238W	1377 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	VPS70	YJR126C	2436 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	TNA1	YGR260W	1605 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	DBF2	YGR092W	1719 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.88	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	PGA3	YML125C	939 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	RHO2	YNL090W	579 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	CSL4	YNL232W	879 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YBR056C-B	YBR056C-B	159 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	LCB2	YDR062W	1686 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	SHE10	YGL228W	1734 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.87	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	ACF2	YLR144C	2340 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	UTP7	YER082C	1665 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	SEC12	YNR026C	1416 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	MTF2	YDL044C	1323 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YKL031W	YKL031W	414 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	RHO4	YKR055W	876 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YPR098C	YPR098C	486 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	ARR3	YPR201W	1215 nt		5.86	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	PMA1	YGL008C	2757 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	MTQ1	YNL063W	945 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	ELA1	YNL230C	1140 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	CWC25	YNL245C	540 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YNR048W	YNR048W	1182 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	ASH1	YKL185W	1767 nt		5.85	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)C	tN(GUU)C	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)F	tN(GUU)F	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)G	tN(GUU)G	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)K	tN(GUU)K	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)L	tN(GUU)L	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)N1	tN(GUU)N1	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)N2	tN(GUU)N2	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)O1	tN(GUU)O1	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)O2	tN(GUU)O2	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	tN(GUU)P	tN(GUU)P	74 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	MRS3	YJL133W	945 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	YPR150W	YPR150W	522 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	HSP104	YLL026W	2727 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.84	□□□□□ -1.47
YKL050C	P35736	HXT5	YHR096C	1779 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	CLB4	YLR210W	1383 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	TEF1	YPR080W	1377 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	TEF2	YBR118W	1377 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YIL060W	YIL060W	435 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	SSP120	YLR250W	705 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	POR1	YNL055C	852 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	MRPL22	YNL177C	930 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YPL071C	YPL071C	471 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	GCR2	YNL199C	1605 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	ECM3	YOR092W	1842 nt		5.83	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	RPT1	YKL145W	1404 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	DON1	YDR273W	1098 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YGR022C	YGR022C	330 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	MRP17	YKL003C	396 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	MTC2	YKL098W	1074 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	STE12	YHR084W	2067 nt		5.82	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	MCM6	YGL201C	3054 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	UTP18	YJL069C	1785 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YBL044W	YBL044W	369 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	PIN2	YOR104W	849 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	ARB1	YER036C	1833 nt		5.81	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YIL092W	YIL092W	1902 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	YDL119C	YDL119C	924 nt		5.8	□□□□□ -1.48
YKL050C	P35736	COX26	YDR119W-A	201 nt		5.8	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms