Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTNNB1P35222 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNNB1P35222 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNB1P35222 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNB1P35222 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms