Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRS3P32247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRS3P32247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRS3P32247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRS3P32247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRS3P32247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRS3P32247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRS3P32247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRS3P32247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRS3P32247 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRS3P32247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRS3P32247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRS3P32247 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRS3P32247 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms