Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINB3P29508 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINB3P29508 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SERPINB3P29508 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms