Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTGFP29279 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTGFP29279 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTGFP29279 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTGFP29279 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTGFP29279 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTGFP29279 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTGFP29279 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTGFP29279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTGFP29279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTGFP29279 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTGFP29279 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTGFP29279 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTGFP29279 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTGFP29279 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTGFP29279 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CTGFP29279 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTGFP29279 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTGFP29279 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTGFP29279 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTGFP29279 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTGFP29279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTGFP29279 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTGFP29279 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTGFP29279 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CTGFP29279 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTGFP29279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTGFP29279 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTGFP29279 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTGFP29279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTGFP29279 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTGFP29279 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTGFP29279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTGFP29279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTGFP29279 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTGFP29279 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTGFP29279 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTGFP29279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTGFP29279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTGFP29279 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTGFP29279 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTGFP29279 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTGFP29279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTGFP29279 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTGFP29279 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTGFP29279 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms