Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD27P26842 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD27P26842 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD27P26842 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD27P26842 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD27P26842 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD27P26842 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD27P26842 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD27P26842 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD27P26842 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD27P26842 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD27P26842 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD27P26842 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD27P26842 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD27P26842 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD27P26842 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD27P26842 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD27P26842 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD27P26842 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD27P26842 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD27P26842 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD27P26842 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD27P26842 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD27P26842 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD27P26842 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD27P26842 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD27P26842 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD27P26842 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD27P26842 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD27P26842 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD27P26842 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD27P26842 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD27P26842 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD27P26842 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD27P26842 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD27P26842 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD27P26842 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD27P26842 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD27P26842 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD27P26842 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD27P26842 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD27P26842 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD27P26842 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms