Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
HMGB2P26583 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HMGB2P26583 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HMGB2P26583 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HMGB2P26583 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms