Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSSP25774 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSSP25774 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSSP25774 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSSP25774 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSSP25774 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTSSP25774 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTSSP25774 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSSP25774 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTSSP25774 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTSSP25774 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms