Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YY1P25490 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YY1P25490 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
YY1P25490 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YY1P25490 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
YY1P25490 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
YY1P25490 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
YY1P25490 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
YY1P25490 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
YY1P25490 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YY1P25490 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YY1P25490 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YY1P25490 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YY1P25490 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
YY1P25490 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YY1P25490 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
YY1P25490 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YY1P25490 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YY1P25490 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YY1P25490 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YY1P25490 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YY1P25490 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YY1P25490 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YY1P25490 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YY1P25490 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YY1P25490 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YY1P25490 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
YY1P25490 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
YY1P25490 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YY1P25490 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YY1P25490 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
YY1P25490 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
YY1P25490 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
YY1P25490 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YY1P25490 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
YY1P25490 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
YY1P25490 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms