Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR2AP24928 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2AP24928 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2AP24928 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2AP24928 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms