Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP11P24347 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP11P24347 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MMP11P24347 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP11P24347 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP11P24347 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MMP11P24347 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP11P24347 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP11P24347 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP11P24347 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP11P24347 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP11P24347 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP11P24347 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP11P24347 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP11P24347 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP11P24347 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP11P24347 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP11P24347 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP11P24347 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP11P24347 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP11P24347 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP11P24347 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP11P24347 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms