Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPRGP23470 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPRGP23470 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PTPRGP23470 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PTPRGP23470 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms