Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPREP23469 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPREP23469 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPREP23469 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPREP23469 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPREP23469 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPREP23469 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPREP23469 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPREP23469 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPREP23469 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPREP23469 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPREP23469 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPREP23469 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPREP23469 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPREP23469 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPREP23469 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPREP23469 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPREP23469 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPREP23469 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPREP23469 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPREP23469 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPREP23469 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPREP23469 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
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