Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALB2P22676 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALB2P22676 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALB2P22676 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALB2P22676 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALB2P22676 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALB2P22676 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALB2P22676 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALB2P22676 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALB2P22676 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALB2P22676 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALB2P22676 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALB2P22676 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALB2P22676 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALB2P22676 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALB2P22676 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALB2P22676 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALB2P22676 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALB2P22676 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALB2P22676 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms